在各土司辖境内制造了诸多事端，从而也为缅甸军民宣慰使司兼东吁王朝国主良渊王：明耶仰达梅（汉名：莽雍罕）夺取云南承宣布政使司边地制造了有利条件。
恰好又有蛮莫安抚使：思正，不听从明云南矿监税使的号令，且常常打劫往来商旅，严重威胁到了宝石采办！
于是明云南矿监税使就私下悄悄派人，去勾结缅甸军民宣慰使司兼东吁王朝国主良渊王欲杀明蛮莫安抚使。
10月13日，天皇上将：吴国佐，在黎平府（五开卫）兵败被俘，明军斩其部众五百八十余人。
11月初2日，南北两京直隶以及各地承宣布政使司地区灾害严重，又苦增矿税，致使兵民多起为盗，因而有浙江承宣布政使司百姓：赵一平，以妖术倡乱。
还大肆宣扬一路走至南直隶徐州（徐州左卫），又遇到同党：孟化鲸，等人联合起来招集众人，自称是；宋皇朝后裔，并建立了官署，拟于明年二月份约集结各方人马同时起事。
怎奈被南直隶南镇抚司锦衣卫队察觉，事情败露，赵一平被杀，其余同党还未起事而失败。
12月初3日，叛贼：吴国佐，被贵州承宣布政使司衙门处以斩立决伏诛，明军又献俘叛军首领：杨应龙，至京师由明神宗：朱翊钧，下令碎尸万段，并斩叛军首领长子：杨朝栋，及其家族党羽于京畿外城宣武门菜市口。
12月初5日，泰西国（意大利人）欧洲耶稣会传教士：利玛窦，泛海八万里，来到东方亚洲大陆上的大明帝国，先后在广东承宣布政使司广州府（广州前卫、广州后卫、广州左卫、广州右卫）、肇庆府（肇庆卫）、韶州府（韶州守御千户所）、南雄府（南雄守御千户所），江西承宣布政使司南昌府（南昌卫）、南直隶苏州府（苏州卫）等地进行传教活动，并学大明江淮官话。
还广泛与大明地方官吏和士大夫们接触，以便更加清楚的了解大明帝国的国情和风俗礼仪。
之后便从南直隶北上，在京畿北直隶天津卫居住了六个月，由明天津卫税监：马堂，向朝廷进贡泰西传教士：利玛窦，所献方物，还奏报泰西传教士请求入京的消息。
谁知被大明礼部以《大明会典》不载大西洋，真伪不可知？以及泰西传教士所献之物不宜入宫中为由，请赐给冠带令其回国，不许在南北两京境内居住，务与大明汉人交往，别生事端。
然而明神宗却不纳，他认为有趣，再加上国本之争以来本身就与官员们不和，因此才特此下诏，准许泰西传教士入京。
在明万历二十九年公元1601年正月初5日，辽东都指挥使司关外明建州左卫军民指挥使：佟·努尔哈赤（爱新觉罗·努尔哈赤）亲率199位使臣带着镇守平定辽东都指挥使司女真各部的名义，去京城朝贡大明天子，还得到了明神宗的表扬。
而明建州左卫军民指挥使一边向朝廷表示守卫辽东都指挥使司的职责，一边又送厚礼孝敬明神宗皇帝陛下，同时还与朝中官员们接触，并借机刺探大明军情。
只有明建州右卫军民指挥使：爱新觉罗·舒尔哈齐，不同他认为大明天子待自己恩宠有加，对建州女真右卫日后强大有帮助，还能巩固自己地位，便心甘情愿朝贡。
正月14日，回到建州女真三卫的明建州左卫军民指挥使为了稳定哈达女真残部，便将自己的三女儿：爱新觉罗·莽古济，下嫁给哈达女真部贝子：纳拉·吴尔古代，为妻。
同时在大明帝都北直隶紫禁城内，恰逢又传来关外海西女真哈达部被灭的消息？这让明神宗：朱翊钧，大怒直接指责明建州左卫军民指挥使：佟·努尔哈赤，擅自杀害大明龙虎将军兼哈达女真部贝勒：纳拉·猛骨孛罗，之事还让他立即归还哈达女真部土地，并传令让哈达女真部复国。
面对朝廷的公然偏袒，明建州左卫军民指挥使不敢反驳，只能照办，便将哈达女真部贝子：纳拉·吴尔古代，送还所部，使其成为哈达贝勒爷重掌哈达女真部。
正月24日，泰西传教士抵达大明北直隶顺天府京畿紫禁城内。
2月初2日，身穿皮弁服的明神宗：朱翊钧，亲自在紫禁城太极殿内召见了番邦使者，此系大明帝国天皇帝陛下亲自接见的第一位欧洲传教士。
而这位泰西传教士：利玛窦，也不负众望地向明神宗进献了；三座天主圣像、圣母像、天主经典、二台自鸣钟、铁弦琴、珍珠嵌十字架，以及世界各国地图，简称「万国图志」，至此大明汉人才知道世界上有五大洲。