虽死，不过幕府左近将监的本部却借着大雾绕到了明军右侧，趁着明军骑兵的追击队形尚在松散时，突然发起了攻击，并与正面的幕府和泉守部队相互呼应，从两面交替打击明军的中队。
幕府左近将监的二千人骑兵，疾驰到离敌军仅有3町（三百步）的地方，一起呐喊后，就从左侧发动攻击，打乱敌军阵形后便立即撤离。
而幕府和泉守的八百余骑兵，则向顽强抵抗的辽东明军铁骑追击，打退了二千明军。
将近午时，倭军左右翼的部队才从山上迂回到位，完成了对明军的三面包围，以幕府筑前守：小早川景隆，居中、幕府左近将监：立花宗茂，在左、幕府大津城城主：小早川秀包，与幕府月山富田城主：毛利元康，在右，三方同时发起了总攻。
一瞬间四面八方的倭军分布在沿山遍野，由两山夹空将我军围住，明东征提督见情势危急，立即跃马冲至阵前，与手下骁将数十人亲自手持神机箭射击。
看到明东征提督如此英勇神武，也让明军将士们瞬间士气大振，继续振作起来浴血奋战，双方又打成了僵局。
在这个紧要关头，从马山馆撤下来救援的明东征左副总兵：杨元、明东征左副总兵左参将：郑文彬、明东征左副总兵监军：王鲁希，率领的援军也终于赶到了。
直接从倭军尚未合拢的北面一起杀入，为被困的明军们打出了一条后退的生路。
这支援军带有自己本部的一千骑兵。
此时明东征提督：李如松，觉得反击的机会终于来了，他并没有打算撤退，而是继续试图整军出击。
但幕府治部少辅：吉川广家、幕府代总大将：户川达安、幕府三河守：吉见元赖、幕府左卫门佐：天野五郎兵、幕府右兵卫尉：三吉殿、幕府周防守：佐波殿，等倭军将领们也纷纷上前夹击。
这让明军战士有些招架不住了！毕竟没带重火炮以及大规模火箭队、战车营，故此明东征提督见倭军势大，一时间不能抵挡。
而仅在明军后方跟随的李氏朝鲜八道都元帅：金命元，则带领一百名李氏朝鲜军队负责观战，全程不敢参与作战。
与李氏朝鲜京畿右道防御使：高彦伯，汇合之后就开始在远处放箭。
很快明军就向北方的惠阴岭撤退，在被倭军追击了一段路后，亦于酉时，才回到了王京，至此「碧蹄馆之战」画下序幕。
战乱过后，明东征提督通过审问倭军俘虏以及截获李氏朝鲜文书中所得情报，重新估计了一下倭军人数，他断定李氏朝鲜官员说谎，并且还发现→射伤我之家丁及马匹者，俱是尔国之箭！
这充分的说明了，有李氏朝鲜人在帮助倭军作战，让他非常失望。
正月28日，明东征提督在上报战况给朝廷兵部的怒斥李氏朝鲜文书后，便立即返回了临津江重新布防。
2月初6日，明神宗：朱翊钧，为了堵住群臣们的嘴以稳定局面，同时也想把明皇三子：朱常洵，留在京中暂时不封为亲王就藩，便下诏暂停三位皇子并封亲王之皇命……。
这边虽然明军把防线缩回到京畿右道临津江以北，但是京畿右道汉城府周围，仍活跃着各路李氏朝鲜人的武装势力。
而顶替李氏朝鲜兵曹备边使：李镒，之职的李氏朝鲜兵马佥节制使：李薲，也率兵3千人，仍驻扎在京畿右道临津江南岸的坡州牧。
以及新任的李氏朝鲜全罗左道观察使：权栗，也接替了李氏朝鲜全罗左道巡察使：李洸，之职开始率兵2千3百人驻守在京畿右道汉城府高阳郡地带。
至于李氏朝鲜京畿右道防御使：高彦伯、李氏朝鲜平安西道义军首领：李时言，则驻扎在京畿右道杨州牧蠏逾岭。
同时汉城府周围还有4路僧兵部队在对抗倭军，待明军撤退之后，倭军要做的第一件事就是剿灭僧兵。
因此2月初9日，一支1千人的僧兵与倭军，在汉城府以西20公里的慈城遭遇，一场血战下来，僧兵们被歼灭了，但倭军也受到了一些损失，最后不得不退回汉城府。
由于僧兵的奋战，也令得倭军疲于奔命，四处救火故而这「秃山防御战」击退倭军后，李氏朝鲜全罗左道观察使兼全罗左道巡察使：权栗，也响应了明军的攻势，进军至汉城府西北15公里的幸州城。
这幸州城是一座山城，滨临汉江，三面环水，一面陡坡，易守难攻，更重要的是，幸州城是俯瞰碧蹄馆至汉城府之间的要隘，扼守着倭军北上或明军南下的咽喉，战略位置之重要不言而喻。
因此汉城府的倭军决计不惜任何代价，都必须要拿下幸州城，一来筑起抵御明军的防线，二来杀鸡儆猴，希望能把各路李氏朝鲜军队给吓跑。