今秦贼在延安府鄜州宜君县，不过闯将李自成当责成秦抚，中原流寇在汝州（汝州卫）者仅有老回回马守应等部数贼，当专注于中原剿抚。
而督理两臣宜令专攻闯王，应让洪军门以陕西总镇总兵：王承恩、平凉府总兵：孙显祖，等边军、川兵二万人出关，由汝州（汝州卫）、南阳府急赴汝宁府光州固始县断其后。
在让卢军门以宁远卫指挥佥事：祖大乐、宁远卫左参将：祖宽，率兵二万由凤阳行都督府颍州（颍川卫）、寿州（寿州卫）奔赴庐州府六安州英山县截断其前。
随后淮安府总督：朱大典、凤阳行都督府提督：杨御蕃，等将领应屯兵于庐州府六安州霍山县防其东 突，应天府总镇巡抚：张国维，应派安庆府总兵：许自强，屯兵于安庆府潜山县、太湖县，防其流寇进入安庆府。
而湖广总镇巡按：王梦尹，当以黄州府总兵：秦翼明，屯兵于黄州府麻城县、蕲州黄梅县，防其流寇南冲。
至于南阳府邓州（邓州守御千户所）、德安府随州、襄阳府枣阳县之间，则由郧阳府巡抚：宋祖舜，处理各路兵马，若合围则贼定无所逃遁，在歼其首领则余贼自破也。
这时农民军：闯王（高迎祥）扫地王（张一川）等二十四营流寇，继续攻打南直隶徐州（徐州左卫），但久攻不克。
随后就向西攻陷归德府虞城县，入河南承宣布政使司。
另外农民军：一字王（拓先龄）、曹操（罗汝才）、扫地王（张一川）等五营，由河南承宣布政使司归德府赶赴开封府仪封县石家楼，被明宁远卫指挥佥事率军悄悄在归德府野鸡冈守御百户所拦截。
断其流寇前锋，在分兵设伏，以步兵诱敌，遇贼于雪园既战。
官军佯装兵败被流寇们争先驰逐，关键时刻明宁远卫指挥佥事鸣鼓举旗，从东西两翼杀出，再出辽东骑兵配合明军火铳队攻击流寇，打得流寇们大乱，被明军三面追击，斩首一千四百人。
这时湖广行都指挥使司的流寇们，分为二部；一路往襄阳府均州（均州守御千户所）、一路入四川承宣布政使司夔州府。
中原流寇们则汇集于开封府兰阳县，明四司总督：卢象升，立刻移驻到凤阳行都督府寿州（寿州卫）负责剿贼。
2月12日，湖广承宣布政使司黄州府流寇们，再次杀入安庆府潜山县又攻陷太湖县，而湖广行都指挥使司郧阳府、湖广承宣布政使司襄阳府的流寇们，则进犯郧阳府竹山县（竹山守御千户所）。
接着明甘肃总镇总兵：柳绍宗，率军出击，在陕西都指挥使司靖虏卫打败农民军：过天星（惠登相）与九条龙等八营流寇。
吓得其余流寇们西逃并劫掠兰河，又南扰巩昌府会宁县。
明五司总督：洪承畴，则檄榜明汉中府副总兵：左光先、明甘肃总镇总兵：柳绍宗，继续合兵击贼。
让流寇从庆阳府安边守御千户所北逃，在进入宁夏后卫花马池守御千户所。
由宁夏后卫明军联合围剿，明军力战攻打流寇，使诸贼们请降，被明陕西总镇巡抚：甘学阔，接受并安插其部数万人于延安府。
但流寇们马上就叛变了，还劫掠延安府延长县、延川县，两地。
3月15日，山西承宣布政使司流寇们攻陷了辽州和顺县。
在剿贼之际，明五司总毒：洪承畴，奏报朝廷称“流寇多在陕西承宣布政使司、河南承宣布政使司山中，闻其附近州府县一有粮饷便劫掠，由南阳府淅川县水运以通湖广承宣布政使司荆州府、襄阳府贩卖，可艘船只拦截，宜派人在淅川县断粮。”
在明军采取行动之时，农民军：九条龙、整齐王（张胖子）就从襄阳府南漳县、光化县，攻陷了襄阳府谷城县。
在进逼郧阳府保康县，还把二千里内的居民房舍全被焚烧殆尽。
接着又攻陷了郧阳府竹溪县、房县（房县守御千户所），流寇们在得知保康县内粮食空虚就不进入了，这使得明四司总督：卢象升，听闻消息后，急忙率领诸将追逐流寇到襄阳府谷城县。
得知流寇再次来到襄阳府，可着实让明襄忠亲王：朱翊铭，对这些流寇们恨之入骨啊！他连忙发了襄亲王府库房白银一千两，给明四司总督当做奖励。
由于明军围追得太猛，迫使流寇们北走湖广行都指挥使司郧阳府，官军们三道并进，待大雾升起之时，流寇们迷路看不清方向，不知大军以至，仓猝应战。
遭到了明军们的镇压，流寇兵败逃奔板桥山中，明军继续追击砍杀，导致坠落山崖的流寇无数。
还斩杀了流寇贼将：黑煞神、飞山虎，又追奔流寇数十里地，一路上尸横遍野。
此时明河南总镇巡抚：陈必谦，亦讨南阳府内乡县、淅川县，一带的余寇，而明宁远卫左参将：祖宽、明承天府总兵：李重镇，则由兴都留守司承天府荆门守御千户所到达荆门州，防其流寇逃奔。
在会师明重庆府总兵：秦翼明