之后，由明毅宗：朱由检，便走到御门前面。
而司礼监与宫女们负责撑着伞团，走在后面，亲军二十六卫则一直守在皇极殿与御门处，以及皇帝陛下身边护卫着。
所有上朝官员还要填写〈注籍〉也就是自己的官职和名字，由明中书舍人：肖俊鹏，负责记录；入朝官员，是否有打哈欠？吐痰？放屁？等不雅行为。
待换上了龙袍（不是衮服，而是红、蓝、黑、黄，四色龙袍）的皇帝陛下，坐上龙位之后，早朝便算开始了。
以明司礼监秉笔太监：曹化淳，为主，缓缓走出皇极殿外，大声宣布入朝议政。
于是乎，四品以上的在京官员以及来京官员们，全部入御门内排列，既皇极殿外，而明毅宗则在皇极殿内，高坐龙椅与群臣们商议早朝之事，所谓有事启奏无事退朝…。
待一番商议结束后，明毅宗就率领着文武官员们下朝了，时间大约在辰时左右。
之后更换了黄龙色（常服）的皇帝陛下，就在文华殿内举行了「经筵日讲」所有六部尚书、都察院左、右都御史、内阁大学士以及有爵位的朝臣勋戚们都要前来参加，还有六科都给事中、特进光禄大夫们，很多人也在听讲的行列中出现。
皇帝则在身材魁梧的北镇抚司锦衣卫队，编属的北镇抚司锦衣卫大汉将军20人的保卫下，首先摆驾来到文华殿内。
在这文质彬彬的场合中，北镇抚司锦衣卫大汉将军们也都免除了甲胄，改换上袍服，但仍携带有金瓜锤、长柄刀，等必不可少的武器，随时准备护驾。
大明皇帝则在文华殿内，面南坐定，传谕百官们进入殿内行礼作揖，至此鸿胪寺官员们才将书案摆在御座面前专供圣鉴。
另一张则摆设在数步之外，为讲官们所用，所以参加听讲的官员们鱼贯而入，分列于书案左右，经筵和其他所有的仪式一样，必有其目视耳听的对称均衡，先一日用楷书恭缮的讲义，此时已经陈列于案几之上。
在赞礼官呼唱之下，两员身穿红袍的讲官和两员身穿蓝袍的展书官出列，他们都是翰林院中的优秀官员。
以讲官面对皇帝，展书官在书案两侧东西对立，首先是讲官作揖叩头礼毕，左边的展书官膝行接近书案，打开御用书本讲义，用铜尺压平。
此时左边的讲书官也已经趋前，站在中央的位置上开始演讲…。
待讲完之后，书本盖复如前，讲官及展书官退列原位，以便右边的同僚们履行任务，左边讲官所讲授的是〈四书〉，右边讲官所讲授的则为历代历史，此种节目历时大半天才结束。
期间只有讲官们可以口讲指划，其他全部人员都要凝神静听，即便是皇帝也不能例外。
当经筵快要结束之时，京城内突然有通政使司官员来报，说有飞骑加急？居然是；南直隶凤阳行都督府中都留守司，被流寇们焚掠了一番的消息！
明毅宗听后，立刻取消经筵日讲，并迅速更换上了（青袍）首先跑去奉先殿内，向祖宗们的灵位哭诉，在亲自去皇城祭告太庙，又命令文武百官们都更换上了（吉服）前来哀悼大明列祖列宗。
随后就下令逮捕明凤阳行都督府总镇巡抚兼都察院右佥都御史：杨一鹏，下北镇抚司诏狱，在命明山东总镇巡抚兼兵部右侍郎：朱大典，总督凤阳行都督府漕运并代理凤阳行都督府总镇巡抚官职，与明五司总督：洪承畴，一起合力剿贼。
而明五司总督则立刻上奏，请求道“四川总镇巡抚、总镇总兵俱移驻夔州府，进援湖广承宣布政使司襄阳府与陕西承宣布政使司汉中府，而湖广总镇巡抚、总镇总兵则分驻承天府兴都留守司、襄阳府，郧阳府巡抚则移驻去郧阳府、襄阳府，凤阳行都督府漕督则移驻到凤阳行都督府颍州（颍川卫）、亳州（武平卫），进援汝宁府、归德府，而山东总镇巡抚则移镇到淮安府进援南直隶地区，山西总镇巡抚则移到平阳府蒲州（蒲州守御千户所）进援河南府陕州灵宝县，陕西总镇巡抚则移西安府商州，围剿汉中府与兴安州（兴安守御千户所）等地的流寇，河南总镇巡抚则移汝州（汝州卫）、南阳府之间，保定府巡抚、总镇总兵移驻北直隶广平府邯郸县可南北策应。”
这些计策全部被朝廷批准，并且下令让明五司总督务必要在五个月之内，把这帮中原流寇们一网打尽。
3月12日，湖广承宣布政使司流寇攻陷了黄州府麻城县，而黄州府蕲州农民军：爬天王（黄大盗）拥有部众八百人，但在出动军队劫掠蕲州（蕲州卫）时，因兵力分散而被村民们擒获住。