苏若晴解决了贵妃的阴谋后，在宫中度过了一段相对平静的日子。她继续专心地为皇后调养身体，同时也在太医院传授一些现代医学知识给太医们，虽然他们一开始有些抵触，但在看到实际疗效后，也渐渐接受了。
然而，平静的日子并没有持续太久。一日，苏若晴正在太医院整理医书，突然听到外面传来一阵骚乱。她走出去一看，只见一群太监和宫女神色慌张地奔走。询问之下，才知道宫外来了消息，京城中出现了一种奇怪的疫病，已经有不少百姓感染，而且这疫病传播速度极快，短短几天，感染人数就不断攀升。
皇上得知此事后，立即召集太医院众人商议对策。苏若晴也一同前往。朝堂之上，气氛凝重，太医们你一言我一语地讨论着，但都没有提出有效的解决办法。
“朕听闻此疫病来势汹汹，诸位爱卿可有良策？”皇上眉头紧锁，焦急地问道。
一位资历较老的太医站出来说：“陛下，臣等已经派人去查看患者症状，初步判断这疫病十分棘手，患者先是发热咳嗽，而后便会浑身无力，呼吸困难，且我们尝试了以往治疗类似病症的方法，均不见成效。”
苏若晴听后，心中思索起来。她请求皇上允许她出宫去查看患者的具体情况。皇上应允了，还派了一队侍卫保护她的安全。
苏若晴来到京城的疫病隔离区，一进去，就闻到一股刺鼻的气味。患者们痛苦地呻吟着，有的已经奄奄一息。她没有丝毫退缩，逐一查看患者的症状，询问他们发病前后的情况。
经过一番仔细观察，苏若晴发现这种疫病与现代的一种传染病有相似之处。她决定借鉴现代的防治方法。首先，她吩咐人将患病和未患病的百姓彻底分开，防止交叉感染。然后，她让侍卫们帮忙寻找石灰，对感染区域进行全面的消毒。
同时，苏若晴根据患者的症状，开了几副药方。然而，药材的准备却遇到了困难。因为疫病突发，京城中的药材很快就被抢购一空。苏若晴只好带人去寻找那些生长在野外的草药。
在寻找草药的过程中，苏若晴遭遇了一些百姓的误解。他们认为疫病是苏若晴这些医者无能导致的，甚至有人向她扔石头。但苏若晴没有放弃，她耐心地向百姓解释防治疫病的方法，试图安抚他们的情绪。
经过几天几夜的努力，在苏若晴和太医院众人的共同协作下，终于控制住了疫病的蔓延。感染的患者在服用了苏若晴的药方后，病情逐渐好转。
京城的百姓们得知是苏若晴帮助他们度过了这场危机，纷纷对她感恩戴德。宫中也传来了好消息，皇后的身体在这段时间里，在其他太医的照料下，并没有出现反复，这让苏若晴松了一口气。
皇上对苏若晴在此次疫病中的表现大为赞赏，赏赐了她许多珍宝。苏若晴却向皇上请求，将这些赏赐换成了对京城医馆的资助，希望能够培养更多的医者，以防备未来可能出现的疾病。皇上被她的无私所感动，答应了她的请求。
经此一役，苏若晴不仅在宫中，在整个京城都成为了受人敬仰的女医，她的名字传遍了大街小巷。但她知道，自己肩负的责任更重了，她要继续钻研医术，为这个时代的人们带来更多的福祉。