府灵璧县之战中，由明燕亲王世子：朱高炽，率领大军从后方偷袭明军粮草，在冲入中军活捉明北平行都指挥使：平安，唯有明平燕将军：盛庸，独自率军向南在淮水南岸排列战船。
随后明燕武亲王率领的大军和朝廷明军在淮河隔江对峙，燕军中军都督府署都督同知：丘福、燕军左军都指挥使：朱能，率数百精锐向西行二十余里，悄悄渡过淮河，并对明平燕将军所部发动突袭。
在此前的灵璧之战中，已经心胆俱丧的明军，又在燕军的冲击之下一溃千里，明平燕将军仅以单骑逃走，淮河上的明军舰船尽归燕军，明燕武亲王遂率大军渡过淮河，占领盱眙县。
接着燕军中军都督府署都督同知偷偷渡过淮河，出现在明军后面，成功牵制住明军，打得他们力不能支，只得退守长江。
5月17日，燕军至扬州府首府江都县（扬州卫），结果明扬州卫指挥使：王礼，等文臣武将纷纷率众出降。
5月19日，燕军到应天府六合县占领此地逼近江浦县（江淮卫）。
5月20日，燕军已经先后攻克了中都留守司凤阳行都督府泗州（泗州卫）、扬州府（扬州卫）、淮安府（淮安卫、大河卫）等地，迫使明惠宗急忙派遣，身为明燕武亲王表姐的明庆成郡主：朱恭倩，入燕军大营内谈判。
企图割地与明燕武亲王求和，但是明燕武亲王却不准许。
因为经过这四年的拉锯战之后，明燕武亲王也分析出了形势，只要明惠宗在位一天，全国地方军队就会抵抗一天，而自己就永远都是叛王，但如果一旦攻占了应天府皇城赶走了明惠宗，那么自己就可以成为一国之君。
相信到时候也没有多少人敢反对自己？
因为大家都是抱着观望的态度，所以才让燕军能够顺利的一路南下，当时的建文朝廷中，早就已经乱作一团，很多地方将领干脆按兵不动，隔岸观火。
此时浦子口巡检使司也就成为了，朝廷在长江以北的最后一道防线，由明平燕将军：盛庸、明魏国公：徐辉祖，等人率领朝廷最后的一支精兵驻扎与此，准备做出最后的抵抗。
6月初1日，由明燕武亲王亲自指挥作战，但却因为轻敌深入，导致被朝廷明军围攻，渐渐落入下风，眼看精疲力尽就要被围困了，在关键时刻由明燕武亲王二子：朱高煦，率领的北平行都指挥使司兵马及时赶来救援。
这让明燕武亲王很是感动，当即说了一句“我儿当勉之！世子多疾。”
于是更加让明燕武亲王二子非常卖命的带兵冲锋，最终才将朝廷明军击退。
而明平燕将军则率部退守到镇江府首府丹徒县（镇江卫）高资港，之后明惠宗立即派明右军都督府署都督佥事：陈瑄，率领水师进行增援。
结果没想到的是在6月初2日，明右军都督府署都督佥事就在浦子口巡检使司向燕军投降，也许是因为自己曾在明魏国公兼中山武宁王：徐达，手下当差的原因。
因此大喜过望的明燕武亲王，当天就祭祀大江之神，次日即率军渡江。
6月初3日，当日微风飘扬，长江不波，明平燕将军所部看到原本舳舻相衔，旌旗蔽空，戈矛耀日，金鼓震动的陈都督所部水师明军，却突然亮出了燕王的旗号，众人都无不惊愕不敢动。
但很快明平燕将军就命令军队仓促列阵，却被燕武亲王：朱棣，本人亲率的精锐骑兵冲击之下迅速溃散，南岸明军几乎全军覆没，使得明平燕将军再次单骑逃脱。
而镇江府首府丹徒县（镇江卫）守军们，在看到长江之上水师舰船尽数投降燕军之后，心胆俱裂，说了一句“海舟皆已降，吾何能力也？”
6月初6日，明镇江卫指挥使：童俊，也只得开城投降，因此镇江府首府丹徒县（镇江卫）也失守了。
6月初8日，燕军驻军龙潭巡检使司，而应天府南京皇城已近在眼前。
6月11日，燕军前锋成功直逼应天府南京皇城而来，明谷宣亲王：朱橞，与明曹国公：李景隆，得知消息后被迫打开金川门投降，至此皇城彻底沦陷。
而此刻燕武亲王本打算直奔皇城奉天殿去的，但却被群臣们给拦住了，表示直接进去会遇到明惠宗建文帝：朱允炆，不如先去太庙祭祖。
于是6月13日，燕军才从金川门进入南京，而明惠宗则在皇宫奉天殿内自焚殉国？
待明燕武亲王：朱棣，进入皇宫之后，看见宫中燃起熊熊大火，宫女与宦官们四处奔跑，放眼望去整个皇宫无一人敢抵抗，而明惠宗则下落不明？