同时后金天聪汗：爱新觉罗·皇太极，当即命令留兵八百驻守遵化卫，自己则亲率后金蒙古联军接着南下，向大明帝都北直隶顺天府方向进军，兵峰已逼近蓟州与蓟州卫地区。
这时明辽东总镇经略：袁崇焕，才亲自带领九千关宁铁骑急转南进，想实施其第二步想法，那就是把后金蒙古联军们给阻截在蓟州卫。
此时之前派出的明山海卫总兵：赵率教，带领下4千明军已经阵亡，导致第一道防线阻拦失败！（实际上袁督师故意这样做的？）。
因此战报传到朝廷时，让明毅宗非常震惊，他连忙命明蓟州总兵：刘策，做好抗敌准备，毕竟此地乃是横在遵化县（遵化卫）与通州三卫之间的屏障，距离京城东郊的通州右卫约有140里。
然而明蓟州总兵却早就被袁督师给调去守密云县（密云后卫、密云中卫）去了，且后金蒙古联军曾两次败在关宁铁骑手下，因此并没有与当地的关宁驻军交战？（也不排除事先私下议和过，有引狼入室之典故）。
所以就引起了朝中极大部分官员们，都怀疑袁大人的布置方略，似乎是在有意要放后金蒙古联军进来？
因为本来蓟州、蓟州卫与遵化县、遵化卫，都是有重兵把守的，正常情况下不可能短时间内就被快速攻破，就是因为袁督师下令换防，才导致了这些地区的轻易沦陷。
再加上朝中官员们上书的猜忌（袁督师是否勾结了东虏建奴？）因此明毅宗连忙下令，让袁督师不得离开蓟州一步。
故此在11月10日，袁督师就上疏明毅宗称“臣恳请陛下让我部兵马进入蓟州稍作休整，在细致地侦察一下敌我形势，然后严格注意东虏建奴鞑子的动向，定会奋力阻截住他们，一定不会让东虏与北虏越过蓟西半步。”
也使得后金蒙古联军们不与换防的关宁驻军交战，而是直接绕路到东北方向的顺天府顺义县（营州左屯卫），再往通州卫出发。
11月14日，袁督师的探报夜不收，侦察到了后金蒙古联军大队已经潜越过蓟西，这样袁督师在蓟州的第二道防线阻拦又彻底落空了，（疑似袁督师与后金蒙古联军故意做样子，演戏糊弄朝廷的？）。
然而实际上袁督师还没等朝廷回复，就以军情紧急为由，直接采取了「将在外，军令有所不授」的方法，又是一边前进一边下令地方驻军换防。
不过袁督师在蓟州拦截失败后，并没有选择直接往西尾随而去追击后金蒙古联军，而是前往位于蓟州西南的河西务。
还打算设立第三道防线［通州三卫］用来阻截。
不过这也导致了两支后金蒙古联军的兵峰，都已经到达了通州卫附近，距离京城只有40里地了！
这也立即引起了通州卫、通州左卫、通州右卫、定边卫、神武中卫，五路驻军们的关注，为此明毅宗大怒，直接下令让袁督师不惜一切代价都要把后金蒙古联军给赶出去。
另外又不断催促集结各路勤王明军们，来到京师做好两手准备。
11月16日，袁督师带领下的关宁军才急行军到达河西务，由于河西务在天津三卫和北直隶帝都之间，大约离京师120里，位于顺天府三河县西南、通州三卫东南。
而此时后金蒙古联军们则是已经接近了通州左卫。
在探报口中得知袁督师会在通州三卫设防？
于是再次绕道顺义县（营州左屯卫）、三河县（兴州后屯卫、营州后屯卫）与宣大明军作战并直奔京城而来，其中还击溃了明宣府总镇总兵：满桂，本部兵马。
这时的后金蒙古联军们直接选择了围攻京师，导致了双方的战线，都推到了京师城下，眼看战事紧急袁督师也不得不给出一个说法了，就在河西务召开军事会议。
之后9千关宁铁骑先行出发，其中明宁远卫标统：吴三桂，日夜赶路行进120里入京，汇报东虏入侵京师戒严的消息，因此关宁军便驻扎在了京师外城广渠门外。
面对后金蒙古联军们的大举进攻，顿时让明毅宗有些乱了方寸，他一时之间竟不知启用谁来当做主帅？
经过内阁商议后，首先推出启用年届七旬、且已经退休在籍的前任明辽东总镇经略：孙承宗，来做统帅，毕竟孙督师熟知东虏建奴鞑子的战略，由他来负责京畿地区的防务，那是在合适不过了。
但是此话一出，当即就遭到了有私人恩怨的明太子太保兼兵部尚书：王在晋，的反对，以孙督师年老体衰不堪重任为由，想劝退皇帝陛下。