兵三千八百余人，且自备粮饷赶赴救援。
很快诸堡次第被收复，惟有宁夏卫总镇（宁夏卫、宁夏前卫、宁夏左屯卫、宁夏右屯卫、宁夏中屯卫）这五卫屡攻不克！
于是官兵们便分为五路逼近城下，由明宁夏卫总镇监军副使：梅国桢、明陕西提督：李如松，统率辽东都指挥使司铁骑、万全都指挥使司宣府镇宣府三卫军队、山西行都指挥使司大同府四卫军队一起包围过去。
一时间明军声威大震。
6月15日，明军再一次攻城，然而依旧连战不下，起初明陕西三边总督：魏学曾，派遣人招降叛军宁夏卫总镇总兵：刘东旸、叛军宁夏卫总镇右副总兵：许朝，两人在平凉府固原州固原卫总镇境内，停留了十余日等待消息。
但却被明宁夏卫总镇监军副使给弹劾，明神宗当即下令责备他玩忽职守，恰好明固原卫总镇副总兵：李昫，渡过黄河又迟了点，导致河套部袄儿都指挥使司的叛军们先进入宁夏卫总镇境内，也让明军再次作战失利。
这让明陕西三边总督很是生气，就上疏朝廷要求明宁夏卫总镇监军副使不要再参与兵事，而明神宗就命令明宁夏卫总镇监军副使遵守这一点，但明宁夏卫总镇监军副使却颇为不满意。
等明陕西三边总督来到中军帐之后，明宁夏卫总镇监军副使立刻，就在诸将面前指责他的过失，诸将们则观望不定，只能任由明宁夏卫总镇监军副使上奏弹劾明陕西三边总督坐实玩忽职守之罪。
此刻安土桃山幕府倭寇正规军对李氏朝鲜王国的大举入侵，深深地震惊了整个大明帝国朝廷，如今朝堂内外的群臣们纷纷商议，到底要不要出兵去援助李氏朝鲜王国，而争论不休。
因当年沿海长达一百多年的倭患，几乎让所有人都非常的很痛恨倭寇和浪人，但倭寇的凶狠与顽强，大明君臣们也是有所耳闻的，现在大批侵朝幕府军队全都是正规军，战力远非当年的倭寇可比。
况且大明帝国在「庚戌之变」之后的几十年里，从未面临过如此大规模的战争，能否战胜侵朝幕府大军，更是让大明君臣们实在没有太大的把握。
不过在安土桃山幕府关白：丰臣秀吉，让琉球中山王国臣服幕府萨摩藩并朝贡的消息传来京城时，更是彻底的激怒了大明君臣，再加上这次的吞并李氏朝鲜王国战机，已经让大明帝国上下实实在在的感受到了这个倭寇蛮人的野心。
况且大明君臣们早已习惯了，以自己为天朝上国的地位，古语云“卧榻之侧，岂容他人酣睡？”
再则从明神宗：朱翊钧，的角度来看，他自然也绝不能容忍安土桃山幕府，这个曾经朝贡过大明帝国的附属国如此嚣张。
又遇上明兵部左侍郎兼都察院右都御史：宋应昌，在上疏中说道“关白之图李氏朝鲜王国，其意是在谋夺华夏，吾国救李氏朝鲜王国，非止为保附属国也，若李氏朝鲜王国固，则东保辽东都指挥使司与京师巩固于泰山矣，而我军之救李氏朝鲜王国实为保我大明也。”
这种观点在当时有一定的代表性，大明朝廷上下官员们基本都达成了迎敌于外，毋使入境的共识。
但在询问李氏朝鲜王国使臣，倭寇正规军到底有多少人之时？却发现众人都是一问三不知的样子？有些人则说有几千？有些人则说有几万？
就这样着实是让大明官员们，觉得这些人都是一群智障，便决定自己先派兵前去查看情况。
另一边在6月25日，明军用布袋三万个，盛土用来堆积城墙登城，由明大同总镇总兵：麻贵，率先提议道“三边总督大人，咱们光是围城，恐怕不能够逼迫叛军们出来吧？何不利用黄河之水往城里灌城，水淹叛军，让他们失去外援。”
此计立刻就被明陕西三边总督给采纳了，明军们开始乘势环城筑堤一千七百丈，还决定用黄河之水灌城，并打算击退城外漠南蒙古河套部援军，让城中缺粮。
到时候在逼叛军宁夏王：哱拜，出城投降。
6月28日，经过朝廷商议，兵部决定让辽东都指挥使司出兵救援，便派出了明辽东总镇副总兵：祖承训，先带领5千人马入李氏朝鲜王国作战。
7月初3日，明陕西三边总督决定在众将面前立威，便夸下海口定能剿灭叛军俯首称臣，因此明甘肃总镇巡抚：叶梦熊，听后就向朝廷上奏，请求赐他「尚方宝剑」。
随后明甘肃总镇巡抚、明陕西三边总督、明宁夏卫总镇监军副使，三人定下计策来，下令挖开黄河大坝之水灌城，让水流迅速到达城下。